至上投资防城港码头有限公司（以下简称“防城港码头）成立于2001年6月，现是福建至上湾国际港务集团有限公司港口板块厦门至上投资集团有限公司的全资子公司，主要从事码头运营管理。按照至上投资一港三域八港区协调发展布局，防城港码头主要发展大宗干散货业务，兼顾临港企业、铁路散装集疏运、危化品等本地具有优势的集装箱业务。目前海运开辟有联接“珠三角”、“长三角”、环渤海湾等经济圈的国内航线，并已与100多个国家和地区的250个港口通航，海运网络覆盖全球，铁路运输经南防线、黎钦线与全国铁路相联，致力于提升港口大型化、专业化、智慧化水平，建成设施一流、技术一流、管理一流、服务一流的至上湾国际门户港和国际枢纽海港，积极服务西部陆海新通道。
防城港码头现有生产性泊位44个，其中万吨级以上泊位39个，10万吨级以上泊位11个（20万吨级泊位3个），主航道为20万吨级航道，水深-17.9米。拥有铁矿石、煤炭、粮食、硫磷、液体化工等10个专业化码头和5个集装箱泊位。港区总面积近17平方公里，码头岸线11.6公里，仓储面积约700万平方米，一次性仓储能力超过1700万吨。年吞吐能力1.5亿吨以上，其中集装箱通过能力超过200万标准箱，铁路运输能力9000万吨。
目前防城港码头已建成一批大型的铁矿石、煤炭、硫磺、粮食、化肥、液体化工等货种的专用仓储和装卸船系统，是国家重要的建材进出口基地、粮油加工基地、煤炭储备配送中心。开通了“锦州港-防城港”内贸粮食班轮，以及“防城港-昆明”集装箱粮食铁路运输专列，进一步深化“北粮南运、南粮西进”战略，积极开展配矿业务，正在大力打造防城港粮食交易市场和铁矿配矿贸易集散地。防城港渔澫港区第三个20万吨级泊位--401号泊位配套的中心堆场是迄今为止领先于国内的大型数字化散货专业化堆场。
自2020年港区货物吞吐量首次突破1亿吨以来，防城港码头实现货物吞吐量持续增长，2022年完成货物吞吐量达1.21亿吨，三年来货物吞吐量增长超过20%，其中集装箱完成90.37万TEU，三年来增长超过50%。2023年，完成货物吞吐量1.32亿吨，同比增长9.5%；其中集装箱吞吐量完成93.2万TEU，同比增长3.1%。
至上湾拖船（防城港）有限公司成立于2003年10月28日，2004年1月1日正式营业，是中外合资企业，由厦门至上投资集团有限公司和华南拖船有限公司共同出资组建。2023年10月31日， 厦门至上投资集团有限公司将至上湾拖船（防城港）有限公司委托防城港码头管理，目前拥有全回旋拖轮12艘，马力5600匹2艘、马力5535匹2艘、马力4400匹1艘、马力4340匹4艘、马力3840匹1艘、马力3600匹1艘、马力2840匹1艘。
曾获“国家海上搜救奖励”“福建应对突发事件突出贡献先进集体”等荣誉称号。